Modelo Autogénico - admite que a célula eucariótica terá surgido a partir de organismos procariontes por invaginações sucessivas de zonas da membrana plasmática seguidas de especialização.
Modelo Endossimbiótico - admite que a célula eucariótica terá surgido da associação entre organismos diferentes, em que um deles (Endossimbionte) vive no interior do outro, beneficiando ambos da associação.
Limitações:
- *Não explica claramente a origem do núcleo da célula eucariótica;
- *Não esclarece, como é que o DNA nuclear comanda o funcionamento do cloroplasto e da mitocôndria.
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